1、微生物菌株鑒定服務(wù)詳細(xì)內(nèi)容
微生物因?yàn)轶w積小、質(zhì)量輕、適應(yīng)性強(qiáng)、繁殖能力強(qiáng)等特點(diǎn)，廣泛分布于自然界中。通過DNA測序?qū)ξ⑸镞M(jìn)行物種鑒定（菌種鑒定）是比傳統(tǒng)生化鑒定更先進(jìn)的鑒定方法。DNA測序不依賴菌種本身特點(diǎn)，對(duì)所有菌種均可使用。比傳統(tǒng)生化鑒定更加快速，準(zhǔn)確。明舟生物憑借多年的微生物檢測經(jīng)驗(yàn)為您可提供快速、權(quán)威的微生物檢測服務(wù)，包括細(xì)菌16srDNA鑒定和真菌18srDNA鑒定/真菌ITS鑒定。
2、細(xì)菌16srDNA鑒定
16S rDNA是編碼原核生物核糖體小亞基rRNA （16S rRNA）的DNA序列，長度約為1540bp，存在于所有細(xì)菌染色體基因組中。16S rDNA分子大小適中，突變率小，是細(xì)菌系統(tǒng)分類學(xué)研究中常用、有用的“分子鐘”。其序列包含9或10個(gè)可變區(qū)（variable region）和11個(gè)恒定區(qū)（constant region）。保守序列區(qū)域反映了生物物種間的親緣關(guān)系，而高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。16S rDNA分子的序列特征為不同分類級(jí)別的近緣種系統(tǒng)分類奠定了分子生物學(xué)基礎(chǔ)。近幾年來，國內(nèi)外學(xué)者采用不同的分子生物學(xué)方法對(duì)各種細(xì)菌的16S rDNA進(jìn)行了廣泛的研究，獲得了大量的16S rDNA序列信息，并集中于NCBI數(shù)據(jù)庫中。將測序得到的16S rDNA序列在NCBI上進(jìn)行Blast比對(duì)，即可獲知與該序列同源性較高的已知序列，為確定菌種的分類學(xué)地位提供依據(jù)。
3、送樣要求
1）、若提供平板、甘油菌或穿刺菌，請(qǐng)注明培養(yǎng)條件，菌種培養(yǎng)需特殊培養(yǎng)基的請(qǐng)?zhí)峁┡囵B(yǎng)基；請(qǐng)確保您提供的平板或斜面上的單菌落經(jīng)過至少三次的分離純化。因?qū)嶒?yàn)樣品不純造成的測序套峰，我們將收取全額的實(shí)驗(yàn)費(fèi)用。
2）、若提供基因組DNA樣品，請(qǐng)確保其濃度≥10ng/μl，總體積≥50μl，樣品定量檢測結(jié)果將以我們?yōu)闇?zhǔn)。
3）、若提供的菌株為革蘭氏陽性菌，建議您提供基因組DNA。
4）、若提供的為培養(yǎng)后的菌液，請(qǐng)確保包裝的密封性和菌液的濃度，使終離心后菌體質(zhì)量不低于0.5g。
5）、我們不接受具有致病性的樣品。如果您的菌株帶有致病性，請(qǐng)?zhí)峁┰摼甑幕蚪MDNA，并對(duì)其進(jìn)行處理以滅活致病菌。
4、提供結(jié)果
1）、進(jìn)行引物設(shè)計(jì)合成；
2）、 PCR擴(kuò)增18S rDNA/ITS；
3）、PCR產(chǎn)物純化；
4）、測序，序列比對(duì)分析。
5、 序列文件
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